שיטות לזיהוי כימיקלים אורגניים

בתהליך ייצור, מחקר ובדיקה של תרופות, נתקלים לעתים קרובות בהפרדה, טיהור וזיהוי של תרכובות אורגניות. זיהוי, הפרדה וטיהור של תרכובות אורגניות הם שלושה מושגים קשורים אך שונים.
מטרת ההפרדה והטיהור היא להשיג טוהר מהתערובת, אך הדרישות שונות, ושיטות הטיפול שונות. הפרדה היא הפרדה של מרכיבי התערובת. בתהליך ההפרדה, מרכיב של התערובת הופך לרוב לתרכובת חדשה באמצעות תגובה כימית, והוא מצטמצם לתרכובת המקורית לאחר ההפרדה. ישנם שלושה מקרים של טיהור, האחד הוא לנסות להמיר את הזיהומים לתרכובות הנדרשות, המקרה השני הוא להפריד את הזיהומים לתרכובת אחרת באמצעות התגובה הכימית המתאימה (אין צורך לצמצם את התרכובת המופרדת), ו- שלישית היא הפרדה בשיטות פיזיקליות (הפרדת נוזלים, כרומטוגרפיה וכו').
הזיהוי מבוסס על המאפיינים השונים של תרכובת כדי לקבוע איזו קבוצה פונקציונלית היא מכילה ואיזו תרכובת היא. לדוגמה, כדי לזהות קבוצה של תרכובות, יש צורך לקבוע אילו תרכובות הן כל אחת.